Счета-фактуры должны выставлять следующие категории налогоплательщиков.

1. Организации, которые совершают облагаемые НДС операции, в том числе по нулевой ставке. Это правило распространяется на налоговых агентов – плательщиков НДС (п. 3 ст. 169 НК), а с 2019 года – на плательщиков ЕСХН (п. 3 ст. 346.1 НК). Кроме того, выставлять счета-фактуры должны те, кто получил освобождение от налога по статье 145 НК. Сумму НДС в счете-фактуре они не указывают, а пишут «Без налога (НДС)» (п. 5 ст. 168 НК).
2. Организации-посредники, которые реализуют товары (работы, услуги) от своего имени по договору комиссии или агентскому договору. Они выставляют счета-фактуры, если комитент или принципал применяет общую систему налогообложения или ЕСХН без использования освобождения от НДС (п. 1 ст. 169 НК, раздел II приложения 1, п. 20 раздела II приложения 5 к постановлению Правительства от 26.12.2011 № 1137).
3. Экспедиторы, которые организуют перевозку для заказчика с привлечением третьих лиц, а также застройщики (заказчики, выполняющие функции застройщика), которые организуют строительство для инвестора с привлечением подрядчиков. В вопросах оформления и регистрации счетов-фактур такие организации приравниваются к посредникам (раздел II приложения 1, п. 1 раздела II приложения 3 к постановлению Правительства от 26.12.2011 № 1137).
4. Организации, которые получили от покупателя или заказчика аванс в счет предстоящей реализации (п. 1 и 3 ст. 168 НК).
5. Организации, которые вывозят в страны ЕАЭС товары, освобожденные от НДС по статье 149 НК, (подп. 1.1 п. 3 ст. 169 НК).
6. Бывшие покупатели, которые возвращают или «перепродают» тот же товар бывшим продавцам.

Не нужно выставлять счета-фактуры в следующих случаях:

• операции не облагаются или освобождены от НДС по статье 149 НК. Например, при выдаче денежных займов (подп. 15 п. 3 ст. 149 НК). Исключение – реализация товаров в страны ЕАЭС (подп. 1.1 п. 3 ст. 169 НК);
• покупатель (заказчик) не является плательщиком НДС (освобожден от НДС), и продавец подписал с ним соглашение об отказе от оформления счетов-фактур. В такой ситуации счета-фактуры можно не выставлять, даже если совершенная операция облагается НДС. Например, если продавец – плательщик НДС получил аванс от покупателя на упрощенке, при наличии взаимного соглашения счет-фактуру на аванс составлять не нужно (письмо Минфина от 16.03.2015 № 03-07-09/13808). Кстати, требовать у покупателя документы, подтверждающие, что он не платит НДС на законном основании, продавец не обязан (письмо Минфина от 30.03.2016 № 03-07-09/17700);
• в сделках с взаимозависимыми лицами для целей налогообложения продавец увеличивает цену товаров, работ, услуг до рыночного уровня и корректирует налоговую базу по НДС (письмо Минфина от 01.03.2013 № 03-07-11/6175).

Такой порядок предусмотрен пунктом 3 статьи 169 НК.

Отметим, что «не нужно выставлять» – это не запрет. Если ваша организация продает товары или услуги, освобожденные от налогообложения, то вы вправе выставлять покупателям счета-фактуры. Просто в них надо делать пометку «Без налога (НДС)». Аналогичные разъяснения есть в письме Минфина от 07.11.2016 № 03-07-14/64908.

Корректировочные счета-фактуры выставляют, когда:

• • стороны договорились изменить стоимость уже отгруженных товаров (выполненных работ, оказанных услуг, переданных имущественных прав). Об этом сказано в абзаце 3 пункта 3 статьи 168 НК;
  • продавец передал товары не полностью (недопоставка товаров) (письма Минфина от 12.05.2012 № 03-07-09/48 и от 12.03.2012 № 03-07-09/22, ФНС от 12.03.2012 № ЕД-4-3/4100);
  • покупатель возвращает продавцу приобретенные у него товары.