ООО находится на ОСН, но освобождено от уплаты НДС как участник проекта «Сколково» по ст. 145.1 НК РФ. Нужно ли выставлять счета-фактуры клиентам?

Вопрос: ООО находится на ОСН, но освобождено от уплаты НДС как участник проекта «Сколково» по ст. 145.1 НК РФ. Нужно ли выставлять счета-фактуры клиентам?
 
Ответ: Если между контрагентом и ООО (участником проекта «Сколково»), которое применяет освобождение от НДС по ст. 145.1 НК РФ, отсутствует соглашение о том, что счета-фактуры не составляются, то счета-фактуры выставлять нужно с соответствующей отметкой или штампом «Без НДС».
 
Обоснование: Согласно п. 1 ст. 145.1 Налогового кодекса РФ организация, получившая статус участника проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом от 28.09.2010 N 244-ФЗ «Об инновационном центре «Сколково» (далее — проект «Сколково»), имеет право на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость.
Порядок выставления счетов-фактур предусмотрен в отношении налогоплательщиков, освобожденных от НДС по ст. 145 НК РФ (п. 5 ст. 168 НК РФ). При этом согласно пп. 1 п. 3 ст. 169 НК РФ при совершении операций по реализации товаров (работ, услуг), имущественных прав лицам, не являющимся налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, и налогоплательщикам, освобожденным от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога, по письменному согласию сторон сделки счета-фактуры не составляются.
Соответственно, если между контрагентом и ООО (участником проекта «Сколково»), которое применяет освобождение от НДС по ст. 145.1 НК РФ, отсутствует соглашение о том, что счета-фактуры не составляются, счета-фактуры выставлять нужно с соответствующей отметкой или штампом «Без НДС».